本試劑盒由上海語燕生物出品,采用可以特異性結(jié)合 DNA 的離心吸附柱和緩沖液系統(tǒng),提取細(xì)菌基因組 DNA。離心吸附柱中采用的硅基質(zhì)材料為上海語燕生物新型材料,能夠高效專一吸附 DNA,可最大限度去除雜質(zhì)蛋白及細(xì)胞中其他有機化合物。提取的基因組 DNA 片段大,純度高,質(zhì)量穩(wěn)定可靠。使用本試劑盒提取的基因組 DNA 可用于各種常規(guī)操作,包括酶切、PCR、文庫構(gòu)建、Southern 雜交等實驗。
使用前請先在漂洗液中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶體上的標(biāo)簽。所有離心步驟均為使用臺式離心機在室溫下離心。本試劑盒僅適用于革蘭氏陰性菌基因組提取,若用于革蘭氏陽性菌基因組提取,需自備部分試劑或者選購 “R32717 革蘭氏陽性菌基因組 DNA 提取試劑盒”。
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收集菌體:取細(xì)菌培養(yǎng)液 1 - 5mL,12000 rpm 離心 1 min.,盡量吸除上清。
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菌體懸浮與 RNA 去除(革蘭氏陰性菌):向菌體中加入 250 μL 溶液 A,振蕩或用移液器吹打使菌體充分懸浮,向懸浮液中加入 40 μL 的 RNase A (10 mg/mL),振蕩 15sec,室溫放置 5 min。
菌體懸浮與破壁(革蘭氏陽性菌,額外步驟):如果是革蘭氏陽性菌,可在第 2 步操作前加入溶菌酶溶液進(jìn)行破壁處理,溶菌酶及溶菌酶緩沖液需自備。具體方法為:向菌體加入 500uL 70% 乙醇,冰浴 20min,12000rpm 離心 1min,棄上清,菌體沉淀加入 110μL 溶菌酶的緩沖液(20mM Tris, pH8.0;2mM Na2 - EDTA;1.2% Triton X - 100)和 70μL 溶菌酶溶液(50 - 100mg/mL),37℃處理 30 - 60min。之后再進(jìn)行后續(xù)步驟。
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蛋白酶 K 處理:向管中加入 20μL 的蛋白酶 K (10mg/mL),充分混勻,70℃放置 10 min,此時可見菌液呈清亮粘稠狀。
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溶液 B 處理:向管中加入 220 μL 溶液 B,振蕩 15sec,70℃放置 10 min,瞬時離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠。
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乙醇添加與混合:向管中加入 220 μL 無水乙醇,充分混勻,振蕩 15sec,溶液變清亮,此時還可能會出現(xiàn)絮狀沉淀,不影響 DNA 的提取,可將溶液和絮狀沉淀都加入到吸附柱中,靜置 2 min。
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離心與棄廢液:12000 rpm 離心 2 min. 棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
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第一次漂洗:向吸附柱中加入 600μL 漂洗液 (使用前請先檢查是否己加入無水乙醇)。12000 rpm 離心 1 min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
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第二次漂洗:向吸附柱中加入 600μL 漂洗液。12000 rpm 離心 1 min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
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第三次漂洗:重復(fù)操作步驟 8。
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去除殘余漂洗液:12000 rpm 離心 2 min,將吸附柱敞口置于室溫或 50℃溫箱放置數(shù)分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,否則漂洗液中的乙醇會影響后續(xù)實驗,如酶切、PCR 等。
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洗脫液添加與室溫放置:將吸附柱放入一個干凈的離心管中,向吸附膜中央懸空滴加 50 - 200 μL 經(jīng) 65℃水浴預(yù)熱的洗脫液,室溫放置 5 min,12000 rpm 離心 1 min。
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再次洗脫:離心所得洗脫液再加入吸附柱中,室溫放置 2 min ,12000 rpm 離心 2 min,即可得到高質(zhì)量的細(xì)菌基因組 DNA。